大人気を呼んだ同題の美少女SFアニメのテレビシリーズをもとに、西川新作作画や追加作画を交えながら三部作に構成した劇場版の第2部。後藤圭二監督によるディレクターズ・カット版。惑星アウレーの労働者の側に立つエクレール。その結果、西川宇宙惑星連合の実質的支配階級ノーブルズとその機関政府総局に楯突く形になったエクレールとリュミエールは、GOTTの登録を抹消された！　追われる立場になったエクレールたち。二人の抹殺命令を受けた粛清部隊チーム2たちをかわしながら、彼女たちはGOTTの本部へと乗り込む。そこに待つものは!　テレビシリーズ第12話から第18話あたりまでのエピソードを再構成。テレビシリーズ中盤のハイテンションなパートを大筋にしながら、主人公たちにからむ強烈な意外性の部分をクライマックスに設定。深遠なSF世界観を新作部分の効果で、より明快に伝えようとしている。